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PyTorch 单机模型并行最佳实践

2020-09-16 13:42:42 更新

原文: PyTorch 单机模型并行最佳实践

注意

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作者申力

模型并行在分布式训练技术中被广泛使用。 先前的帖子已经解释了如何使用 DataParallel 在多个 GPU 上训练神经网络; 此功能将相同的模型复制到所有 GPU,其中每个 GPU 消耗输入数据的不同分区。 尽管它可以极大地加快训练过程,但不适用于某些模型太大而无法放入单个 GPU 的用例。 这篇文章展示了如何通过使用模型并行解决该问题,与DataParallel相比,该模型将单个模型拆分到不同的 GPU 上,而不是在每个 GPU 上复制整个模型(具体来说, 假设模型m包含 10 层:使用DataParallel时,每个 GPU 都具有这 10 层中每个层的副本,而当在两个 GPU 上并行使用模型时,每个 GPU 可以承载 5 层)。

模型并行化的高级思想是将模型的不同子网放置在不同的设备上,并相应地实现forward方法以在设备之间移动中间输出。 由于模型的一部分仅在任何单个设备上运行,因此一组设备可以共同为更大的模型服务。 在本文中,我们不会尝试构建庞大的模型并将其压缩到有限数量的 GPU 中。 相反,本文着重展示并行模型的概念。 读者可以将这些想法应用到实际应用中。

Note

对于模型跨越多个服务器的分布式模型并行训练,请参见分布式 RPC 框架入门,以获取示例和详细信息。

基本用法

让我们从包含两个线性层的玩具模型开始。 要在两个 GPU 上运行此模型,只需将每个线性层放在不同的 GPU 上,然后移动输入和中间输出以匹配层设备。

import torch
import torch.nn as nn
import torch.optim as optim


class ToyModel(nn.Module):
    def __init__(self):
        super(ToyModel, self).__init__()
        self.net1 = torch.nn.Linear(10, 10).to('cuda:0')
        self.relu = torch.nn.ReLU()
        self.net2 = torch.nn.Linear(10, 5).to('cuda:1')


    def forward(self, x):
        x = self.relu(self.net1(x.to('cuda:0')))
        return self.net2(x.to('cuda:1'))

请注意,除了五个to(device)调用将线性层和张量放置在适当的设备上之外,上述ToyModel看起来非常类似于在单个 GPU 上实现它的方式。 那是模型中唯一需要更改的地方。 backward()torch.optim将自动处理渐变,就像模型在一个 GPU 上一样。 调用损失函数时,只需确保标签与输出位于同一设备上。

model = ToyModel()
loss_fn = nn.MSELoss()
optimizer = optim.SGD(model.parameters(), lr=0.001)


optimizer.zero_grad()
outputs = model(torch.randn(20, 10))
labels = torch.randn(20, 5).to('cuda:1')
loss_fn(outputs, labels).backward()
optimizer.step()

将模型并行应用于现有模块

只需进行几行更改,就可以在多个 GPU 上运行现有的单 GPU 模块。 以下代码显示了如何将torchvision.models.reset50()分解为两个 GPU。 这个想法是继承现有的ResNet模块,并在构建过程中将层拆分为两个 GPU。 然后,通过相应地移动中间输出,覆盖forward方法来缝合两个子网。

from torchvision.models.resnet import ResNet, Bottleneck


num_classes = 1000


class ModelParallelResNet50(ResNet):
    def __init__(self, *args, **kwargs):
        super(ModelParallelResNet50, self).__init__(
            Bottleneck, [3, 4, 6, 3], num_classes=num_classes, *args, **kwargs)


        self.seq1 = nn.Sequential(
            self.conv1,
            self.bn1,
            self.relu,
            self.maxpool,


            self.layer1,
            self.layer2
        ).to('cuda:0')


        self.seq2 = nn.Sequential(
            self.layer3,
            self.layer4,
            self.avgpool,
        ).to('cuda:1')


        self.fc.to('cuda:1')


    def forward(self, x):
        x = self.seq2(self.seq1(x).to('cuda:1'))
        return self.fc(x.view(x.size(0), -1))

对于模型太大而无法放入单个 GPU 的情况,上述实现解决了该问题。 但是,您可能已经注意到,如果您的模型合适,它将比在单个 GPU 上运行它要慢。 这是因为在任何时间点,两个 GPU 中只有一个在工作,而另一个在那儿什么也没做。 由于中间输出需要在layer2layer3之间从cuda:0复制到cuda:1,因此性能进一步恶化。

让我们进行实验以更定量地了解执行时间。 在此实验中,我们通过运行随机输入和标签来训练ModelParallelResNet50和现有的torchvision.models.reset50()。 训练后,模型将不会产生任何有用的预测,但是我们可以对执行时间有一个合理的了解。

import torchvision.models as models


num_batches = 3
batch_size = 120
image_w = 128
image_h = 128


def train(model):
    model.train(True)
    loss_fn = nn.MSELoss()
    optimizer = optim.SGD(model.parameters(), lr=0.001)


    one_hot_indices = torch.LongTensor(batch_size) \
                           .random_(0, num_classes) \
                           .view(batch_size, 1)


    for _ in range(num_batches):
        # generate random inputs and labels
        inputs = torch.randn(batch_size, 3, image_w, image_h)
        labels = torch.zeros(batch_size, num_classes) \
                      .scatter_(1, one_hot_indices, 1)


        # run forward pass
        optimizer.zero_grad()
        outputs = model(inputs.to('cuda:0'))


        # run backward pass
        labels = labels.to(outputs.device)
        loss_fn(outputs, labels).backward()
        optimizer.step()

上面的train(model)方法使用nn.MSELoss作为损失函数,并使用optim.SGD作为优化器。 它模拟了对128 X 128图像的训练,这些图像分为 3 批,每批包含 120 张图像。 然后,我们使用timeit来运行train(model)方法 10 次,并绘制带有标准偏差的执行时间。

import matplotlib.pyplot as plt
plt.switch_backend('Agg')
import numpy as np
import timeit


num_repeat = 10


stmt = "train(model)"


setup = "model = ModelParallelResNet50()"
## globals arg is only available in Python 3\. In Python 2, use the following
## import __builtin__
## __builtin__.__dict__.update(locals())
mp_run_times = timeit.repeat(
    stmt, setup, number=1, repeat=num_repeat, globals=globals())
mp_mean, mp_std = np.mean(mp_run_times), np.std(mp_run_times)


setup = "import torchvision.models as models;" + \
        "model = models.resnet50(num_classes=num_classes).to('cuda:0')"
rn_run_times = timeit.repeat(
    stmt, setup, number=1, repeat=num_repeat, globals=globals())
rn_mean, rn_std = np.mean(rn_run_times), np.std(rn_run_times)


def plot(means, stds, labels, fig_name):
    fig, ax = plt.subplots()
    ax.bar(np.arange(len(means)), means, yerr=stds,
           align='center', alpha=0.5, ecolor='red', capsize=10, width=0.6)
    ax.set_ylabel('ResNet50 Execution Time (Second)')
    ax.set_xticks(np.arange(len(means)))
    ax.set_xticklabels(labels)
    ax.yaxis.grid(True)
    plt.tight_layout()
    plt.savefig(fig_name)
    plt.close(fig)


plot([mp_mean, rn_mean],
     [mp_std, rn_std],
     ['Model Parallel', 'Single GPU'],
     'mp_vs_rn.png')

img

结果表明,模型并行实现的执行时间比现有的单 GPU 实现长4.02/3.75-1=7%。 因此,我们可以得出结论,在 GPU 之间来回复制张量大约有 7%的开销。 有改进的余地,因为我们知道两个 GPU 之一在整个执行过程中处于空闲状态。 一种选择是将每个批次进一步划分为拆分管道,这样,当一个拆分到达第二个子网时,可以将下一个拆分馈入第一个子网。 这样,两个连续的拆分可以在两个 GPU 上同时运行。

通过流水线输入加速

在以下实验中,我们将每批次120张图像,进一步划分为 20 张图像的均分。 当 PyTorch 异步启动 CUDA 操作时,该实现无需生成多个线程即可实现并发。

class PipelineParallelResNet50(ModelParallelResNet50):
    def __init__(self, split_size=20, *args, **kwargs):
        super(PipelineParallelResNet50, self).__init__(*args, **kwargs)
        self.split_size = split_size


    def forward(self, x):
        splits = iter(x.split(self.split_size, dim=0))
        s_next = next(splits)
        s_prev = self.seq1(s_next).to('cuda:1')
        ret = []


        for s_next in splits:
            # A. s_prev runs on cuda:1
            s_prev = self.seq2(s_prev)
            ret.append(self.fc(s_prev.view(s_prev.size(0), -1)))


            # B. s_next runs on cuda:0, which can run concurrently with A
            s_prev = self.seq1(s_next).to('cuda:1')


        s_prev = self.seq2(s_prev)
        ret.append(self.fc(s_prev.view(s_prev.size(0), -1)))


        return torch.cat(ret)


setup = "model = PipelineParallelResNet50()"
pp_run_times = timeit.repeat(
    stmt, setup, number=1, repeat=num_repeat, globals=globals())
pp_mean, pp_std = np.mean(pp_run_times), np.std(pp_run_times)


plot([mp_mean, rn_mean, pp_mean],
     [mp_std, rn_std, pp_std],
     ['Model Parallel', 'Single GPU', 'Pipelining Model Parallel'],
     'mp_vs_rn_vs_pp.png')

请注意,设备到设备的张量复制操作在源设备和目标设备上的当前流上同步。 如果创建多个流,则必须确保复制操作正确同步。 在完成复制操作之前写入源张量或读取/写入目标张量可能导致不确定的行为。 上面的实现仅在源设备和目标设备上都使用默认流,因此没有必要强制执行其他同步。

img

实验结果表明,对并行 ResNet50 进行建模的流水线输入可将训练过程大约加快3.75/2.51-1=49%的速度。 距理想的 100%加速仍然相去甚远。 由于我们在管道并行实现中引入了新参数split_sizes,因此尚不清楚新参数如何影响整体训练时间。 直观地讲,使用较小的split_size会导致许多小的 CUDA 内核启动,而使用较大的split_size会导致在第一次和最后一次拆分期间出现较长的空闲时间。 都不是最佳选择。 对于此特定实验,可能会有最佳的split_size配置。 让我们尝试通过使用几个不同的split_size值进行实验来找到它。

means = []
stds = []
split_sizes = [1, 3, 5, 8, 10, 12, 20, 40, 60]


for split_size in split_sizes:
    setup = "model = PipelineParallelResNet50(split_size=%d)" % split_size
    pp_run_times = timeit.repeat(
        stmt, setup, number=1, repeat=num_repeat, globals=globals())
    means.append(np.mean(pp_run_times))
    stds.append(np.std(pp_run_times))


fig, ax = plt.subplots()
ax.plot(split_sizes, means)
ax.errorbar(split_sizes, means, yerr=stds, ecolor='red', fmt='ro')
ax.set_ylabel('ResNet50 Execution Time (Second)')
ax.set_xlabel('Pipeline Split Size')
ax.set_xticks(split_sizes)
ax.yaxis.grid(True)
plt.tight_layout()
plt.savefig("split_size_tradeoff.png")
plt.close(fig)

img

结果表明,将split_size设置为 12 可获得最快的训练速度,从而导致3.75/2.43-1=54%加速。 仍有机会进一步加快训练过程。 例如,对cuda:0的所有操作都放在其默认流上。 这意味着下一个拆分的计算不能与上一个拆分的复制操作重叠。 但是,由于上一个和下一个拆分是不同的张量,因此将一个计算与另一个副本重叠是没有问题的。 实现需要在两个 GPU 上使用多个流,并且不同的子网结构需要不同的流管理策略。 由于没有通用的多流解决方案适用于所有模型并行用例,因此在本教程中将不再讨论。

注意:

这篇文章显示了几个性能指标。 当您在自己的计算机上运行相同的代码时,您可能会看到不同的数字,因为结果取决于底层的硬件和软件。 为了使您的环境获得最佳性能,一种正确的方法是首先生成曲线以找出最佳分割尺寸,然后将该分割尺寸用于管道输入。

脚本的总运行时间:(5 分钟 53.174 秒)

Download Python source code: model_parallel_tutorial.py Download Jupyter notebook: model_parallel_tutorial.ipynb